رینتارو ناتسوکی، دانشآموز دبیرستانیِ کتابخوانی که سالهاست در لاک تنهایی خود فرورفته، در آستانه ی تعطیل کردن کتاب فروشی کتاب های دست دومی است که از پدربزرگ فرهیخته اش به ارث برده؛ جایی که برای او در حکم پناهگاه و مخفیگاهی در برابر دنیای بیرون است و مکانی برای غرق شدن در دنیای واژهها و داستان ها. شبی گربه ی سخنگویی به سراغش می آید و از او درخواست عجیبی می کند: کمک به نجات کتاب ها از دست کسانی که آن ها را به بند می کشند، تخریبشان می کنند، و مورد بی مهری قرار می دهند. مأموریت نجات کتاب ها باعث می شود که آن دو دست به سفرهایی شگفت انگیز در هزارتوهای عجیبی از دنیاهایی ناشناخته و جادویی بزنند و با رقیبانی رودررو شوند که مقابله با آن ها کار بسیار دشواری است. رینتارو در آغاز با مردی آشنا می شود که کتاب ها را زندانی میکند. سپس با مردی مواجه می شود که کتاب ها را شکنجه و سلّاخی می کند تا از آن ها نسخه های بسیار کوتاه شده بسازد. او در هزارتوی سوم با مردی دیدار می-کند که به کتاب ها به چشم کالای مصرفی می نگرد. و در پایان، مأموریت بسیار دشواری به او سپرده می شود که باید خود به تنهایی به سرانجام برساندش؛ کاری که می بایست با سفر به قلمرویی انجام شود که هر کسی جرئت پاگذاشتن به آن را ندارد
