میثم و شهر ترس‌های ممنوعه داستانی مهیج و پر ماجرا از پسری دوازده ساله به نام میثم را روایت می‌کند که به همراه خانوادۀ خود به کوفه مهاجرت می‌کند. میثم پس از ورود به شهر ، درگیر حوادث و اتفاقاتی می شود که تغییرات بزرگی را در او به وجود می‌آورد. آشنایی میثم با شخصیت‌هایی همچون ابراهیم‌بن‌مالک و عباس‌بن‌علی پای او را به جنگی بزرگ باز می‌کند. این کتاب چشم اندازی از زوایا و جلوه های آموزندۀ تاریخ اسلام و آموزه‌های ناب امام علی (علیه السلام) خواهد بود. همچنین تلاش‌های میثم در طول داستان برای سوادآموزی و آموختن خط، ما را با تحول بزرگ خط کوفی که بعدها باعث به وجود آمدن خط های فارسی و عربی می شود آشنا می‌کند.