در این داستان پسر پانزده‌ساله‌ای به طور اتفاقی به دست‌نوشته‌ای از پدرش دست می‌یابد. در حالی که پدرش ۱۱ سال پیش به دلیل ابتلا به بیماری صعب‌العلاجی از دنیا رفته و در آستانه مرگ، نامه‌ی دور و درازی برای پسرش از خود به جا گذاشته‌ است. به گفته مادرش، بیش‌ترین غم و اندوه پدر در آستانه مرگ این بوده‌ است که پیش از آن که بتواند پسرش را بشناسد باید بمیرد. دختر پرتقال گفت و گوی فلسفی و شاعرانه بین پدر و پسری است که در دو زمان مختلف زیسته‌اند. پدر ماجرای آشنایی با همسرش را به شیوه‌ای جذاب برای پسرش بازگو می‌کند. پسر با خواندن یادداشت‌های پدرش به شناخت جدیدی از پدر و مادرش دست می‌یابد و دید جدیدی نسبت به زندگی پیدا می‌کند.