سه نوه، یکی مورخ، یکی انقلابی و دیگری که سودای پولدار شدن در سر دارد، برای دیدار مادربزرگشان به قصبه‌ی جنت‌حصار در حوالی استانبول می‌روند و یک هفته را در خانه‌ی پدربزرگشان که هفتاد سال پیش، به دلیل مسائل سیاسی به آنجا تبعید شده بود، می‌گذرانند. در طول این یک هفته، گذشته و خاطرات نود ساله‌ی مادربزرگ به تدریج زنده می‌شود.
پاموک «خانه خاموش» را به شیوه جریان سیال ذهن نوشته است. پنج شخصیت اصلی در این رمان به روایت‌های جداگانه‌ای می‌پردازند اما این روایت‌ها در عین مستقل بودن با یکدیگر هم پوشانی داشته و در هم می‌آمیزند و به نوعی کامل کننده یکدیگر هستند.